内蒙古国际旅行卫生保健中心于2000年7月26日经中央机构编制委员会办公室《关于各地出入境检验检疫局事业单位机构编制的批复》(中编办字[2000]69号)正式成立的,主要职责:出入境人员健康体检与传染病监测、国际旅行预防接种、卫生保健咨询、医疗保健门诊、卫生检疫技术科研开发与技术服务等。内蒙古国际旅行卫生保健中心是内蒙古自治区卫生厅批准的唯一的独立的健康体检机构,同时也是职业病健康监护、职业病诊断以及职业技术服务的机构。
保健中心是内蒙古地区唯一通过中国质量认证中心ISO9000质量管理体系认证、国家认证认可监督委员会的实验室计量认证和中国合格评定国家认可委员会ISOIEC17025认可的体检机构,实验室出具的检测报告在国际上互认。